Jeu d'espionnage en vue subjective : le joueur incarne Sam Fisher, le meilleur agent de la NSA, et doit enquêter sur des réseaux terroristes menaçant l'Occident. Pour cela, le joueur doit infiltrer des bases ennemies, récupérer des informations, détruire des données compromettantes, le tout sans laisser la moindre trace de ses actes.